1、颁证申请
申请者向认证机构提出申请，索取申请表，并将填写好的申请表返回认证机构。认证机构根据申请表所反映的情况决定是否受理。如同意受理，则书面通知申请人，并将全套调查表及有关资料发给申请人。
申请人将填写好的调查表返回给认证机构。认证机构对返回的调查表进行审查，若没有发现明显违背有机茶标准的情况，将与申请人签定审查协议。一旦协议生效并确认申请人已经支付相关费用后，认证机构将派出检查员，对申请者的茶园、茶叶加工厂和贸易情况进行实地检查，并采集样品。
申请人在递交调查表或在接受检查时，应全面地向认证机构提供相关的证明材料。这些材料对于颁证委员会在确认生产者、加工者、经营者是否按照本标准进行生产和加工，并决定对产品是还予以颁证是非常重要的。这些材料包括茶树生长、产量、投入物的用量和日期，投入物的使用方法、病虫害管理、修剪、采摘记录等；加工和销售记录、产品批号、出入库记录、运输记录等；土壤、鲜叶、商品茶分析记录；等等。
2、颁证检查
认证机构在受理申请后，对申请者所申请的内容都要进行现场检查，以评估其是否达到颁证标准。同时还要现场采集土壤样品和茶叶样品供检测。检查必须在生产季节进行。对茶园的检查面积不得少于申请颁证面积的1/3。这是常规的颁证检查。
为了防止违背有机茶种植和加工的行为，保证产品符合有机茶质量标准的要求、保护消费者的利益，有时还进行不通知的颁证检查。
3、有机颁证
颁证委员会根据检查员的报告、相关的调查表和证明材料，对照有机茶颁证标准，评价申请者是否符合本标准，作出同意颁证、拒绝颁证和有机转换颁证的决定。证书有效期为一年，第二年以后每年必须重新履行申请和检查手续。
同意颁证：如果申请者完全符合本标准，将获得有机茶园/茶厂/经营者证书。
有条件颁证：如果申请者能基本达到本标准，但有必要作若干改进时，在收到申请者愿意对要求进行改进之处的书面承诺后，可以获得有机茶园/茶厂/经营者证书。
拒绝颁证：申请者如达不到本标准，颁证委员会将拒绝颁证，并向申请者提出转化的建议。
